El área de soporte y sistemas de información brinda la asistencia técnica necesaria para llevar a cabo las actividades de la STI que así lo requieran y tiene a su cargo, entre otros, el desarrollo y funcionamiento del Sistema de Información Monitoreo de Acuerdos (SIMA), del Sistema de Información Geográfica (SIG), entre otros.
El área de acuerdos realiza el seguimiento de los acuerdos suscritos en el marco de las sesiones de la CNTI, asiste a mesas técnicas, apoya la realización de las sesiones que se llevan a cabo entre el Gobierno indígena y el Gobierno nacional, monitorea la política pública en materia territorial del PND y produce informes de balance sobre el estado de cumplimiento de los acuerdos.
El área de investigación es la encargada de hacer seguimiento del avance en la garantía de derechos territoriales de los Pueblos Indígenas, en especial los procesos de formalización, protección de territorios ancestrales, restitución de derechos territoriales y cumplimiento a figuras relacionadas con la formalización de derechos territoriales a Pueblos Indígenas en el Acuerdo de Paz. Además, hace seguimiento a los hechos de violencia sociopolítica contra los pueblos y elabora investigaciones a mayor profundidad como insumo analítico para los delegados y las comunidades indígenas.
Observatorio es una herramienta técnica de la STI para la generación de información cualitativa y cuantitativa para la generación de análisis a través de investigaciones, elaboración de contextos, acompañamiento a comunidades indígenas y fortalecimiento de los procesos de incidencia política de los delegados indígenas de la Comisión Nacional de Territorios Indígenas (CNTI).
La propuesta del Observatorio nace en el segundo semestre del 2017 atendiendo el direccionamiento político de los delegados indígenas y se procede a un proceso de construcción colectiva en términos temáticos estratégicos como de legitimidad política. El Observatorio ha venido trabajando conjuntamente con los delegados indígenas en las fases de nacimiento, establecimiento de objetivos, componentes, apuestas políticas, plan de trabajo, ajuste, retroalimentación, evaluación, estrategia de sostenibilidad y socialización de los resultados en el marco de los espacios autónomos de las sesiones de la CNTI.